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胰腺癌，被称为“癌王”，是所有实体瘤中预后最差的一种恶性肿瘤。数据显示，只有大约20%的患者在确诊时具有接受手术的资格，而即便进行了手术，仍有高达90%的患者会面临复发的风险。传统的治疗手段效果有限，因此急需新的治疗策略。在最近的研究中，基于T细胞的免疫治疗特别是肿瘤反应性CD8+ T细胞（TR CD8+ TILs），由于能够特异性识别并消灭肿瘤细胞而受到广泛关注。
然而，目前依然面临着如何准确识别这些具有杀伤能力的T细胞的难题，这成为限制其临床应用的主要瓶颈。传统的方法需要事先进行新抗原预测和体外扩增，整个过程既繁琐又耗时长，并且容易出现漏检。那么有没有更高效且精准的方法呢？
近期，上海医药旗下的上药生物治疗研发团队在这一领域的研究成果登上了国际期刊。上药生物治疗总经理华坚及其团队，与温州医科大学的史植文副研究员、孙洪伟和张岩副主任医师等团队合作，在《Journal of Experimental & Clinical Cancer Research》杂志上发表了题为“Functional tumor-reactive CD8+T cells in pancreatic cancer”的文章。他们开发出一种结合单细胞测序（scRNA-seq）与深度学习（DL）的方法，该方法无需提前了解新抗原即可直接从肿瘤组织内浸润的淋巴细胞中精准识别出肿瘤反应性CD8+ T细胞。
在这项研究的核心流程中，首先是数据收集与处理：获取术后的胰腺癌样本，并进行单细胞转录组测序和T细胞受体测序。接着，利用已验证过的具有肿瘤杀伤力的CD8+T细胞数据（超过3200个细胞）构建训练集。随后采用联合Transformer和1D-CNN深度学习算法架构，对细胞的基因表达进行特征提取和分类。最后，通过在体外的TCR-T细胞杀伤类器官实验，验证模型所识别的TCR是否能够识别并杀死自体肿瘤细胞。
这项研究在技术上取得了多项突破。研究绘制了迄今为止最全面的人类胰腺癌CD8+ T细胞图谱，揭示了不同亚型T细胞中肿瘤反应性T细胞的特征性分布。此外，该研究还发现线粒体功能受损是TR CD8+ T细胞的关键生物学特征，并提出TIGIT-NECTIN2为新的免疫检查点。T细胞受体（TCR）库的分析指出，多个TCR组合的杀伤力更为显著，预测这种多靶点TCR-T细胞疗法将会更为有效。
令人振奋的是，这一发现具备直接的临床价值。研究团队分析了接受新辅助免疫治疗的胰腺癌患者队列，发现TR CD8+ T细胞比例高的患者其临床预后更佳，意味着这种比例可作为筛选免疫治疗受益患者的重要指标。
该研究不仅提供了一种创新的方法来识别胰腺癌中的肿瘤反应性T细胞，还揭示了影响这些细胞功能的重要生物学特征。这为未来更有效的个性化免疫治疗提供了理论依据和实践指导。
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